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八核+七卡！泡泡網(wǎng)DIY個人超級計算機

● 蛋白質(zhì)折疊計算：七卡就是七倍性能！

    一般的商業(yè)CUDA軟件都只能支持單GPU，而且無法利用高端顯卡全部的性能，像Badaboom這樣經(jīng)過特別優(yōu)化的軟件也只能支持雙GPU。雖然很多專業(yè)CUDA計算軟件能支持N多GPU，但民用通用計算軟件只有Folding@Home（蛋白質(zhì)折疊計算）和SETI@home（天文數(shù)據(jù)外星文明分析）這兩個分布式計算支持多GPU。

    Folding@home是一個由斯坦福大學(xué)主持，全球主要硬件廠商共同參與的大規(guī)模公益性分布式運算項目。其主要是研究了解蛋白質(zhì)折疊、誤折以及相關(guān)的疾病，主要研究的疾病包括：癌癥、阿茲海默癥、亨廷頓病、帕金森氏癥等。我想，這是一個比單純跑各種Benchmark來得更有價值的事情。

    將Folding@home程序目錄復(fù)制7份，各自分配不同的機器號并指定不同的GPU，這樣7個蛋白質(zhì)程序就能互不干涉的各自獨立運行，由于7個程序全靠GPU運算，因此CPU占用率非常低，完全不會影響普通2D軟件的運行。

    運行幾個小時之后，性能估值已經(jīng)出來了，7塊顯卡的PPD分值（Points Per Day每日運算得分）都是7000多，總分值高達(dá)53K，已經(jīng)和國內(nèi)第一強人65K的成績相差不遠(yuǎn)了。

    通過內(nèi)置的Benchmark測試來看，每片GTX260+都能夠達(dá)到7K左右的PPD，七卡插一起的性能和單卡相比基本沒有損失，但由于網(wǎng)絡(luò)不穩(wěn)的關(guān)系，長時間運行的話，個別數(shù)據(jù)包算出來的平均PPD會有所下降。